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Hiep Dinh Nguyen 충북대학교 2017 국내석사
Under the emergence of novel H5Nx viruses in the East Asia Flyway, to understand the genetic evaluation of recent avian influenza viruses (AIVs) in South Korea, we investigated AIV gene pools of migratory wild birds collected from four consecutive winter seasons (2013/2014 to 2016/2017). During this study, we collected 2496 specimens wherein total of 153 AIVs were isolated. Genetic characterization of AIVs showed that 110 (71.89%) and 43 (28.11%) were identified as low-pathogenic (LP) and high-pathogenic (HP) AIVs, respectively. Of the 110 LPAI viruses we isolated, all subtypes of Influenza viruses from H1 to H12, except H2 and H9 were detected. Specifically, the proportion of H7 AIVs isolates were 22.3% in total of LPAI AIVs isolates positive samples. Among these LPAI subtypes, the H7N7 subtype was the most common (N=34), followed by H4N6 (N=14) and H5N3 (N=11). In addition, H1N1 and H11N9 subtypes were commonly detected from migratory birds with the same number of virus (N=10). Of the HPAI viruses, the H5N8 subtype (N=36) was the most frequent virus isolated from 2014/2015 and 2016/2017 winter season though their genetic constellations vary with each other. Moreover, the H5N6 (N=6) and H5N7 (N=1) viruses were only isolated in 2016/2017 winter season. Full length phylogenetic analyses of the HPAI H5 viruses revealed that the genetic origins of HPAI H5N8 and H5N6 viruses were different and they can be further separated into at least five and three genotypes of H5N6 and H5N8 viruses, respectively, by reassortments between recent HPAI H5Nx and LPAI viruses which co-circulating in South Korea. Taken together, our results provide evidences that active genetic reassortments of AIVs occurred within wild migratory bird flocks and LPAIVs are likely to have played an important role in the evolution of novel reassortant H5Nx HPAIVs in the East Asia Flyway. 동아시아의 철새 이동경로에서 새로운 조류 인플루엔자 바이러스 (H5Nx)의 출현으로 국내의 최근 조류 인플루엔자 바이러스 (AIVs)에 대한 유전적 진화를 분석하기 위해 네 번의 겨울철 (2013/2014년에서 2016/2017까지)에 수집한 야생 조류에서 분리된 조류 인플루엔자 바이러스의 유전자형을 조사하였다. 이 연구 동안 총 2496 개의 표본을 채취하여 총 153 개의 조류 인플루엔자 바이러스가 분리되었다. 조류 인플루엔자 바이러스의 유전적 특성에 따라 저 병원성 (LP) 및 고 병원성 (HP) 조류 인플루엔자로 각각 110 개 (71.89 %)와 43 개(28.11 %)가 확인되었다. 분리된 110 종의 저 병원성 조류 인플루엔자 바이러스 중 H2형과 H9형을 제외한 H1형에서 H12형까지 모든 아형이 검출되었다. 구체적으로, H7형 조류 인플루엔자의 비율은 저 병원성 조류인플루엔자의 양성 샘플에서 22.3 %였다. 이들 저 병원성 조류 인플루엔자 아형 중에서 H7N7 아형이 가장 많았으며 (N=34), H4N6 아형 (N= 14), H5N3 아형 (N=11) 순이었다. 또한 H1N1 및 H11N9 아형은 동일한 수의 바이러스 (N=10)가 철새에서 발견되었다. 고 병원성 조류 인플루엔자 바이러스 중 H5N8 아형 (N=36)은 2014/2015 및 2016/2017년도 겨울시기에 가장 빈번하게 분리된 바이러스였지만 그들의 유전적 배열은 서로 다르게 나타났다. 또한 H5N6 (N=6) 및 H5N7 (N=1) 아형의 바이러스는 2016/2017년도 겨울철에만 분리가 되었다. 고 병원성의 H5 바이러스의 전장 계통 분석 결과, HPAI H5N8과 H5N6 바이러스의 유전적 기원 다른 것으로 확인되었으며, 최근 HPAI H5Nx와 같이 순환하던 저 병원성의 조류 인플루엔자 바이러스 사이의 재조합에 의해 각각 5개의 H5N6과 3개의 H5N8 바이러스 유전형이 존재하는 것을 확인 할 수 있었다. 결론적으로, 나의 연구 결과는 HPAIVs의 활발한 유전 재조합이 야생 철새 무리에서 발생하고 있으며, LPAIV가 동아시아 비행 경로의 새로운 재조합 H5Nx HPAIV의 진화에 중요한 역할을 하고 있음을 보여 준다.
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